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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenVP40
StrainBundibugyo Ebola Virus (BDBV)
Number of strain5
Gene IDgi_302371216
Protein IDYP_003815434.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
4225Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)172 FTFDLTALK NHLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.1, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*54017NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_110711N0.06
4346Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)293 IGMDPISQG NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_11079N0.32
4145Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)92 IPIWLPLGV NHLA-B*0702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B61, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Ld13NA0DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150615N0.63
4260Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)207 ISFHPKLRP NNA0NA0DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132811N0.83
4128Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)75 LEAMVNVIS NHLA-B*3701, HLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B61, MHC-Kk5NA0DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_04269N0.41
4270Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)217 LLPGKTGKR NHLA-A20 Cattle, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A*3302, HLA-A68.15NA0DRB1_03011N0.18
4202Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)149 LLRIGNQAF YHLA-A3, HLA-B*0702, HLA-B*2702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B626HLA-A*0301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_010514N0.16
4319Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)266 LLVHRLTGK NHLA-A*1101, HLA-A20 Cattle, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.1, HLA-B*27056NA0DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_13223N0.06
4141Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)88 LMKQIPIWL YHLA-A*0201, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3501, HLA-B*3701, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B7, HLA-B8, HLA-Cw*0602, MHC-Db revised13HLA-B8, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, HLA-B35, Mamu-A*0111DRB1_0101, DRB1_01022N0.10
4203Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)150 LRIGNQAFL NHLA-A2.1, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3701, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised12NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_150613N0.37
4200Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)147 LRLLRIGNQ NHLA-B14, HLA-B*27022NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_010540N0.44
4256Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)203 LRPGISFHP NHLA-B*27021NA0DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_15065N0.99
4266Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)213 LRPILLPGK NHLA-B*2702, HLA-B*27052NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_010517N0.60
4356Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)303 LTMVITQDC NHLA-B*58011NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_110711N0.19
4302Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)249 LVPIDPAKN NNA0NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_010521N0.06
4312Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)259 MGIEVPELL YHLA-A24, HLA-B*3501, HLA-B*3701, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kd20HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04265N0.54
4095Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)42 MMSDTPSNS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_110711Y0.25
4096Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)43 MSDTPSNSL YHLA-A1, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5801, HLA-B60, HLA-Cw*04019HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0701, DRB1_07032N0.14
4140Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)87 VLMKQIPIW YHLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5801, HLA-B625HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_132312N0.04
4094Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)41 VMMSDTPSN NHLA-A2.11NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_130410N0.23
4132Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)79 VNVISGPKV NHLA-B*51, HLA-B*5102, HLA-B613NA0DRB1_0101, DRB1_01022N0.12
4122Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)69 VSSAFILEA YHLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*58013HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_13114N0.29
4070Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)17 VYPMRTVST NHLA-A24, HLA-Cw*0401, MHC-Dd3NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_042611N0.02
4224Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)171 YFTFDLTAL NHLA-A24, HLA-B*3801, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-Cw*0401, MHC-Kd8NA0DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB1_15064N0.18
4345Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)292 YIGMDPISQ NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_010528N0.14